يتمثل الهدف الأساسي من المشروع في دعم المحافظة على العناصر النموذجية للتنوع الحيوي البحري والساحلي بالبحر الأبيض المتوسط وإدارتها بشكل دائم. وقد تم تحديد الأعمال المذكورة من أجل استخدامها كنموذج أو كأعمال نموذجية.

علاوة على ذلك، يهدف المشروع الى تنفيذ الأعمال الملموسة التي تندرج ضمن سياق الأولويات التي تم اختيارها على المستويات المحلية والإقليمية، وبالتالي مساعدة البلدان على الإيفاء بمسؤولياتها بموجب ملحق معاهدة برشلونة حول المناطق المحمية ومعاهدة التنوع الحيوي .

وتندرج أعمال المشروع ضمن الأعمال الأكثر استعجالا التي أوصى بها برنامج "سماب"SMAP ، خاصة فيما يتعلق بالإدارة المدمجة للمناطق الساحلية.

إضافة إلى ذلك، يخول المشروع تقسيم تخطيطات الإدارة بالنسبة للمواقع التي تم اختيارها على أنها المناطق الأكثر أهمية بالبحر الأبيض المتوسط. وتندرج جميع هذه المواقع  ضمن جدول المناطق المحمية بالبحر الأبيض المتوسط وفق برتوكول المناطق المحمية المتمتعة بأهمية خاصة. كما وردت بعض المواقع بقائمة اليونسكو ضمن إطار برنامج المجال الحيوي وهو أمر منسجم مع أولويات سماب SMAP.

يمكن تلخيص أهداف المشروع على النحو التالي:

تشجيع تخطيط إدارة المناطق المحمية
تحسين القدرات الوطنية في هذا الشأن
توفير أمثلة لتطبيقات ناجعة ومقاربات تجديدية من أجل إدارة المناطق المحمية
تدعيم مبادلات الخبرات بين الشمال والجنوب